Факультет систем автоматизации управления образован 1 сентября 2009 года в результате реформирования Вооруженных Сил Российской Федерации и военного профессионального образования, в результате слияния трех факультетов автоматизированных систем управления, математического обеспечения автоматизированных систем управления и боевых информационных управляющих систем.

Областью профессиональной деятельности выпускников является управление подразделением корабля или береговой части ВМФ, боевое использование, техническая эксплуатация автоматизированных систем управления сил флота и межвидовых телекоммуникационных систем, поддержание их в заданной степени боевой готовности, испытание новых образцов автоматизированных систем управления, обучение и воспитание личного состава.

Факультет оснащен современными образцами вооружения, военной и специальной техники - системами и комплексами, стоящими на вооружении кораблей Военно-Морского Флота, компьютерными и специализированными тренажерами, учебными стендами и установками.

Состояние учебно-материальной базы факультета обеспечивает формирование требуемых компетенций специалистов Военно-Морского Флота, определяемых требованиями стандартов и квалификационными требованиями к военно-профессиональной подготовке выпускников.

Для решения задач по подготовке специалистов для Военно-Морского Флота факультет обладает высококвалифицированным кадровым капиталом, который соответствует требуемому уровню показателей государственной аккредитации на право ведения образовательной деятельности в сфере высшего образования.